// MCP TOOL REFERENCE

RARAS TOOLS

21 tools from the Raras MCP Server, categorised by risk level.

View the Raras policy → Token cost: 2,175 tokens →

// ALL 21 RARAS TOOLS

READ 21 tools

Read analyze_clinical_case Caso clínico → doenças candidatas + literatura relevante em 1 chamada. Apenas informativo, nunca diagnóstico. Read explain_relation Raciocínio fundamentado sobre o grafo: dada uma pergunta (ex.: "por que o gene X se associa à doença Y?", "... Read find_active_trials Trials ativos com filtro Brazil. Read find_communities Comunidades FEBRARARAS por doença. Read find_diseases_by_phenotypes Match por IDs HPO. Use para diagnóstico diferencial. Read find_papers_for_disease Literatura relacionada a uma doença via embeddings (:SEMANTIC_MATCH, fallback vetorial). Read find_phenotypically_similar Doenças com perfil de fenótipos HPO semelhante (simGIC pré-computado, explicável: nº de fenótipos em comum)... Read find_reference_centers Centros por doença e/ou UF, com CNES. Read find_similar_diseases Vector similarity via embeddings SOTA. Read get_disease_detail Fenótipos HPO, genes, SUS, trials, descrição clínica em PT. Read get_evidence Cross-references de autoridade (Orphanet, MONDO, OMIM, MeSH, GARD, UMLS), status de verificação e PMIDs de ... Read get_graph_stats Contagens e métricas do dataset. Read get_hypotheses Candidatos a reposicionamento de fármacos gerados por associação de genes (guilt-by-association): drogas qu... Read get_literature_relations Relações tipadas extraídas da literatura biomédica (associate/treat/cause/inhibit/stimulate/prevent) entre ... Read get_recent_updates Doenças cujo gêmeo digital ganhou evidência nova (autoria, PubTator3, Open Targets, verificação) nos último... Read get_research_log Registro cronológico do que o agente autônomo fez por esta doença: autoria, mineração de literatura, evidên... Read get_schema Node labels, relationship types e property keys do grafo. Use antes de cypher_query. Read get_sus_coverage CEAF, SIGTAP, PNTN, nível de integração. Read search_diseases Full-text search em 10.468 doenças raras. Suporta filtros SUS/trials. Read search_papers_semantic Busca vetorial sobre 424k papers do PubMed. Use caso clínico, pergunta ou conjunto de sintomas. Read search_phenotypes Lookup HPO em PT ou EN. Retorna IDs HP:.

// FAQ

How many tools does the Raras MCP server have? +

The Raras MCP server exposes 21 tools across 1 categories: Read.

How do I enforce policies on Raras tools? +

Route the Raras server through the PolicyLayer gateway. Define allow, deny, or approval rules per tool in the dashboard — they are enforced on every call before it reaches the server.

What risk categories do Raras tools fall into? +

Raras tools are categorised as Read (21). Each category has a recommended default policy.

Let agents act without letting them run wild.

Route your MCP servers through PolicyLayer and every tool call is checked against your policy before it runs — allow, deny, or require approval. Per-identity grants. Full audit log. Live in minutes.

SECURE YOUR MCP →

Free to start. No card required.

4,600+ MCP servers and 31,000+ tools scanned and risk-classified.